1993年4月27日至29日，海峡两岸关系协会会长汪道涵与海峡交流基金会董事长辜振甫在新加坡举行首次会谈。这是海峡两岸授权的民间机构最高负责人之间的首次会晤，也是隔绝40多年后两岸高层人士的首次正式接触，标志着两岸的“谈判时代已经来临”。

　　双方签署了《两岸公证书使用查证协议》、《两岸挂号信函件查询、补偿事宜协议》、《两会联系会谈制度协议》及《汪辜会谈共同协议》等4个文件。尽管这次会谈只局限于民间性、经济性、事务性和功能性的范围，但其本身所具有的意义及影响引起了台湾岛内及国际社会的高度重视和普遍关注。[详细]

　　1998年10月14日，受海协会邀请的海基会董事长辜振甫先生赴上海、北京参访。辜先生是近五十年来第一位踏足祖国大陆的由台湾当局正式授权的代表，江泽民总书记、钱其琛副总理分别会见辜先生一行，这是海峡两岸自1949年以来最高级别的公开接触。
　　10月15日，辜振甫与海协会长汪道涵会面，双方在会谈中达成了四项共识。汪辜会谈所达成的四点共识，有助于改善两岸关系和两会交流的气氛，加深双方的了解，化解分歧，增进互信，从而为今后两岸两会的进一步交流直至政治谈判的程序性商谈的举行创造了积极的条件。 [详细]

　　2008年6月12日，海协会会长陈云林与海基会董事长江丙坤进行会谈，这是“两会”领导人10年来的首次会谈，标志着中断近10年的“两会”制度化协商正式恢复。 [详细]

　　2008年11月4日，第二次“两会”领导人商谈在台北成功举行，“两会”在台北举行领导人会谈，是“两会”成立以来的第一次，也成为两岸关系继续改善和发展的重要标志，两岸关系步入一个新的里程。陈云林表示，此行开启了两会制度化协商的新里程，标志着两岸关系发展走出了重要的一步。 [详细]
·《海峡两岸海运协议》·《海峡两岸空运协议》·《海峡两岸食品安全协议》·《海峡两岸邮政协议》

　　2009年4月26日，“两会”领导人在南京完成第三次会谈，就两岸空运、金融合作、打击犯罪等三项议题签署协议，并就陆资赴台达成共识。随着这些协议和共识的落实，海峡两岸在隔绝60年后将真正全面实现直接“三通”。 [详细]
·《海峡两岸金融合作协议》·《海峡两岸空运补充协议》·《海峡两岸共同打击犯罪及司法互助协议》

　　2009年12月22日，海峡两岸关系协会会长陈云林与台湾海峡交流基金会董事长江丙坤在台中市举行两会恢复协商以来的第四次领导人会谈。这次会谈签署了三项协议。 [详细]
·《海峡两岸标准计量检验认证合作协议》·《海峡两岸农产品检疫检验合作协议》
·《海峡两岸渔船船员劳务合作协议》

　　2010年6月29日，海协会与海基会在重庆签署了《海峡两岸经济合作框架协议》《海峡两岸经济合作框架协议》两项协议。框架协议的签署是两岸经济合作路线图中至关重要的一步，是为两岸经济关系正常化、制度化、自由化所作的特殊安排，具有里程碑式的意义。[详细]
·《海峡两岸经济合作框架协议》·《海峡两岸知识产权保护合作协议》

　　2010年12月22日，两会领导人第六次会谈圆满落幕。本次会谈签署了《海峡两岸医药卫生合作协议》，并就两岸投保协议达成阶段性共识。[详细]
·《海峡两岸医药卫生合作协议》